Para instalar gvSIG Batoví se debe descargar el fichero .XO correspondiente al paquete que se desea instalar, y ejecutarlo sobre el Ceibalita verde o azul (según el binario descargado).

Para instalar los plugins de gvSIG Educa sobre gvSIG 2.0 hay que seguir los siguientes pasos:

• Ejecutar gvSIG 2.0 (para instalar esta versión, puede descargarse desde http://www.gvsig.org/web/projects/gvsig-desktop/devel/gvsig/2_0_0/version.
• Acceder al menú Herramientas->Administrador de complementos.
• Seleccionar la opción de instalación desde URL, escribiendo la siguiente dirección: http://downloads.gvsig.org/download/gvsig-desktop (debe ir por defecto), y darle a Siguiente.
• Seleccionar los plugins Thematic Maps generator y Thematic Maps viewer document, y darle a Siguiente. 
• Pinchar en Aceptar en las ventanas que aparecen, y finalmente seleccionar la opción para que inicie la descarga.
• Una vez descargado darle a Finalizar.

Se pueden seguir instrucciones más detalladas en el Manual de instalación.